福州市传染病医院始建于1947年，几经迁移，于1957年定于现址（福建省福州市鼓楼区西洪路312号），是目前全省唯一一家集医疗、教学、科研为一体的三级甲等传染病专科医院。

医院始终把追求发展作为第一要务，坚持走“大专科、小综合”的发展道路，立足于传染病大专科，做强做大病毒性肝炎专业，发展与肝炎相关的综合科室，逐步开展肝病内科、肝病外科、肝病产科、肝癌介入治疗等专业。当前院内传染病、艾滋病病房大楼正在建设中，不久一座现代化、人性化的传染病、艾滋病治疗中心病房大楼、门诊大楼，将展现在美女山下，为患者提供宾馆式的服务。

随着卫生体制改革的进一步深入，医院将以实际行动不断解决政府关注，群众关心的“看病难、看病贵”问题，为建设海峡西岸经济区服务，继续奉行“团结严谨求新奋进”的精神，以“质量兴院，科技强院”为办院宗旨，内强素质，外树形象，以优质的服务奉献于社会，奉献于病人。